Одной из основных проблем опреснения морской воды является высокий спрос на энергию, а выбросы углерода в процессе производства энергии могут оказать негативное воздействие на окружающую среду. Концентрированные побочные продукты рассола в процессе опреснения также вызывают серьезную озабоченность, и эти химические вещества могут представлять потенциальную угрозу для здоровья человека, если с ними не обращаться должным образом.