На качество грунтовых вод влияют географическая среда, структура почвы, состав горных пород и деятельность человека. Например, грунтовые воды в некоторых районах могут содержать высокие концентрации железа, марганца, сульфида или высокую жесткость, что приводит к желтому цвету воды, запаху, образованию накипи и другим проблемам.